湿疣疱疹疼痛可大体上分为两种情况，急性的持续湿疣疱疹疼痛和慢性的经常性湿疣疱疹疼痛。
急性疼痛多见于湿疣疱疹炎和损伤，湿疣疱疹炎除血行感染外，更常见的是细菌经尿道逆行至附睾和湿疣疱疹，造成附睾炎、湿疣疱疹炎，临床可见附睾与湿疣疱疹肿胀和疼痛。湿疣疱疹损伤时有外伤史和局部的肿胀及淤血。剧烈运动或房事、暴力有时可引起提睾肌的强烈收缩，从而使系带过长的湿疣疱疹发生扭转并引起湿疣疱疹的剧痛。由于湿疣疱疹扭转后阻断了湿疣疱疹的血液供应，所以湿疣疱疹除剧痛外并有阴囊肿大、皮肤水肿。相对来说，急性疼痛的诊断比较容易。
慢性疼痛时，轻者迁延日久。疼痛较轻、泛化，具有放射性疼，所以不容易判断炎症的确切部位。湿疣疱疹的疼痛不一定与炎症的轻重程度成正比，有些人的神经敏感程度很高，轻度炎症就可引起较严重的疼痛感；而有些人比较迟缓，自我感觉就轻。有的疼痛发生在性生活之后，这可能由于性兴奋使生殖器和生殖腺高度充血所致。有的疼痛系精索精脉曲张或其他部位的疼痛放射而来，如输尿管结石引起的湿疣疱疹放射性疼痛，这时就要仔细鉴别真正的原因以便有效的对症处理。
湿疣疱疹疼痛的治疗应在确定其病因的基础上进行对症治疗，一时查不出原因，则可做镇静和止痛的对症治疗。必要时可采用精索普鲁卡因封闭治疗，这样可以阻断神经痛的痛源和大脑痛觉中枢之间的恶性循环。有些人稍有不适或根本没有不适也能诱发湿疣疱疹的疼痛，这时完全是精神作用在作怪。有些人则把疼痛与手淫联系起来，整天背着沉重的内疚的思想负担。殊不知过度焦虑、过分把注意力集中在性的表现能力上反而会造成精神性阳痿等性功能障碍。
造成湿疣疱疹疼痛的原因很多，自己判断较为困难，千万不要乱用药，最好及早找专科医生求治，以免贻误病情。
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