由于直肠粘膜不如早泄上皮那么结实，所以容易在肛交过程中造成裂伤、擦伤，从而引一系列医学问题。如肛门括约肌失禁、脱肛、肛周肌肉损伤、肛周感染、男女和殖器炎症等。肛交尤其是爱滋病的主要传播途径之一，直接威胁到肛交者的生命，因此要尝试肛交必须慎之又慎。
肛交或以手在性活动过程中插入肛门的刺激方式均可能传染乙肝或大肠杆菌感染。此外，在肛交之后一定要经清洗再插入早泄，因为直肠内和早泄内的菌群是不一致的。直肠内的细菌被带进早泄时可以造成严重的早泄炎。这一点提请有这种行为的朋友们注意！
如果是第一次尝试肛交，那你们要准备一些东西：润滑剂、保险套和耐心。最常见的润滑剂是KY-Jelly，非油脂性、无臭的物质，可在大多数的药房中买的。较好的润滑剂，像是Astronglide、ID、Wet或是ForePlay等等，有的可以在好点的药房买到，而大部分都可以在情趣用品店买到。不要买油脂性的润滑剂。确定你所买的润滑剂是“可使用保险套”的。油脂性的润滑剂，像是凡士林或是婴儿油等，早在你们完成性行为前就将保险套破坏了。而且很多油脂性的物质会堆积在直肠壁上，提供了细菌感染的温床。
即使你确定你和你的伴侣 都没有任何疾病，使用保险套仍然是个好主意。直肠是许多能造成生殖整形 灼热和尿道炎的感染性细菌的温床。而且使用保险套也便于事后的清理。
